Awal berdirinya pesantren ini Kyai Yusuf hanya mendirikan sebuah cangkruk yang di tempati warga desa wringin sebagai tempat menggali Ilmu. Tempat tersebut memang didirikan untuk memfasilitasi warga sekitar
MA Al Hadi adalah lembaga pendidikan swasta islam setara SMA yang berbasis pesantren, dikelola oleh Pesantren Al Hadi Girikusuma Demak.
MA An Nur ini berlokasi diJl. KH. Umar No. 14 Taman Ds. Mengok, Pujer, Kabupaten Bondowoso
MA Al Ma'arif Bondowoso merupakan Lembaga Pendidikan atas setingkat SMA berbasis pendidikan Agama dibawah LP Ma'arif Bondowoso.
MA Bustanul Ulum merupakan lembaga pendidikan swasta setingkat SMA yang berada dibawah kelola pesantren Bustanul Ulum Bondowoso.
Pesantren Bustanul Ulum didirikan oleh " KH. Ahmad Baidlawi " ibnu H. Abdus Syukur pada tanggal 7 Juni 1968 setelah beliau selesai menempuh masa pendidikan pesantren di Pondok Pesantren Al-Wafa Tempurejo Jember
SMK Nurut Taqwa berdiri pada tahun 2014 terletak di Desa Grujugan Kecamatan Cermee Kabupaten Bondowoso yang berada di daerah perbatasan antara Kecamatan Cermee dan Prajekan serta berada di perbatasan dua Kabupaten Bondowoso dan Situbondo.
Madrasah Aliyah Nurut Taqwa adalah salah satu lembaga pendidikan yang berada di bawah naungan Yayasan Pondok pesantren Nurut Taqwa Desa Grujugan Kecamatan Cermee Kabupaten Bondowoso
MA HM. Tri Bakti merupakan sekolah menengah atas setara SMA yang berbasis pesantren, dikelola oleh Pesantren Al-Mahrusiyah Lirboyo Kediri.
MA Al-Mahrusiyah merupakan sekolah menengah atas setara SMA yang berbasis pesantren, dikelola oleh Pesantren Al-Mahrusiyah Lirboyo Kediri.