Yayasan Pondok Pesantren Asy-Syafi’iyyah adalah lembaga pendidikan Islam nonformal (pondok pesantren tradisional) yang bergerak dalam bidang pendidikan ilmu ke-agama-an. Awalnya, lembaga pendidikan ini memakai sistem klasik/ tradisional (salaf) yang terlaku saat itu.
Pesantren Nurul Jannah beralamat di Jl Gerilya Gang Bambu Kelurahan Kelayan B Timur Kecamatan Banjarmasin Selatan. Pesantren Nurul Jannah dirintis oleh KH. Basirun Ali pada tahun 1990.
Pesantren Darul Ulum Kepuhdoko dibangun sejak 1940, kini telah memiliki sebanyak 2.236 santri. Mereka belajar di lembaga pendidikan mulai PAUD, TK, SMP, MTs, SMK dan MAN
Pondok Pesantren Darul Ma’arif didirikan oleh Yayasan Darul Ma’arif dikarenakan berkembangnya pendidikan di bawah naungan Yayasan Darul Ma’arif
Pondok Pesantren Tahfidzul Qur’an Al-Azhary dirintis tanggal 24 November 1946 dengan menekankan pengajaran dan pendidikan hafalan Al-Quran.
Pondok pesantren Al-Istiqomah yang bertempat di Jl. Pekapuran Raya RT. 28 Kelurahan Pemurus Baru, Kecamatan Banjarmasin Selatan yang pada sejarahnya adalah daerah yang masyarakatnya mayoritas beragama Islam
Pesantren Kombos atau Pondok Karya Pembangunan resmi didirikan pada 21 Juli 1977. Berdirinya PKP tak lepas dari sejarah terpilihnya Manado sebagai tuan rumah Musabaqah Tilawatil Quran atau MTQ ke-10 Tingkat Nasional, Juli 1977.
Pesantren Kedunglo Almunadhdhoroh berada di Jalan K.H. Wahid Hasyim, Bandar Lor, Mojoroto, Bandar Lor, Kec. Mojoroto, Kota Kediri, Jawa Timur
Pondok Pesantren Maslakul Huda merupakan lembaga pendidikan yang terletak di dusun Dengok, desa Kandangsemangkon, Kecamatan Paciran, Kabupaten Lamongan, Jawa Timur.
Pondok Pesantren Ath-Thohiriyyah yang berada di Kampung Parakanonje, Desa Karangsalam, Kecamatan Kedung Banteng, Kabupaten Banyumas, merupakan sosok pesantren yang telah mengalami sejarah panjang.