Habib Abdul Qadir bin Ahmad Assegaf juga merupakan guru dari seorang ulama kharismatik Nusantara, Habib Luthfi bin Yahya Pekalongan. Berkaca pada akhlak Habib Ali dan Habib Luthfi, kita bisa melihat akhlak Habib Abdul Qadir pada diri kedua murid beliau. Banyak kisah yang menceritakan tentang kemuliaan akhlak beliau, salah satunya ketika berkunjung ke rumah salah satu murid beliau.
Habib Abdul Qadir bin Ahmad Assegaf pernah memberikan ijazah yang agar kesulitan-kesulitan yang kita hadapi dapat terurai dengan mudah. Beliau adalah Wali Qutub pada zamannya yang sangat terkenal dengan berbagai karomahnya.