Islam Nusantara memiliki kekhasan karena mensinergikan nilai-nilai ajaran Islam dengan falsafah Pancasila, yang menjadi Dasar Negara Indonesia. Sejak awal berdirinya Negara Kesatuan Republik Indonesia, semua agama dan kepercayaan bebas hidup di dalamnya.
Islam Nusantara sudah mendunia, sebagai islam yang ramah dan toleran, kini Islam Nusantara banyak menjadi referensi dunia untuk mengembalikan citra islam sebagai agama rahmatan lil alamin.