Kehadiran Sekolah Tinggi Ilmu Keislaman (STIK) Annuqayah, Guluk-Guluk, Sumenep, Madura, Jawa Timur, pada awalnya didorong oleh keinginan luhur pengurus Yayasan Annuqayah di mana dengan melihat perkembangan santri Annuqayah tahun demi tahun yang semakin bertambah.